Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODC1P11926 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODC1P11926 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms