Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGAP10645 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGAP10645 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGAP10645 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms