Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAA1P09110 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAA1P09110 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms