Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NGFRP08138 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NGFRP08138 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms