Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC1P02654 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC1P02654 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms