Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHDP01880 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHDP01880 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGHDP01880 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGHDP01880 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGHDP01880 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
IGHDP01880 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHDP01880 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHDP01880 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHDP01880 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms