Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX58O95786 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX58O95786 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX58O95786 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms