Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLDN9O95484 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms