Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
USP19O94966 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP19O94966 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP19O94966 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP19O94966 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP19O94966 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP19O94966 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms