Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms