Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms