Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRMUO75648 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms