Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F6O75461 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms