Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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