Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms