Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ZNF208O43345 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ZNF208O43345 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ZNF208O43345 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ZNF208O43345 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ZNF208O43345 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF208O43345 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms