Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNPHO15079 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNPHO15079 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNPHO15079 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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