Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNMO15061 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNMO15061 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNMO15061 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNMO15061 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNMO15061 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNMO15061 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNMO15061 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNMO15061 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNMO15061 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNMO15061 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNMO15061 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms