Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms