Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS6O14544 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms