Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DFFAO00273 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DFFAO00273 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DFFAO00273 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DFFAO00273 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DFFAO00273 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DFFAO00273 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms