Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA2E9PIF3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA2E9PIF3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms