Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms