Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVV-1B6SEH8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVV-1B6SEH8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms