Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRCP1A6NGW2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCP1A6NGW2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms