Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms