Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EME2A4GXA9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms