Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB4A4D0S4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms