Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCE3A1L190 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms