Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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