Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4BQ9Y4P1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms