Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms