Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms