Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.05■□□□□ 0
UBE2J1Q9Y385 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms