Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL20Q9Y2M5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL20Q9Y2M5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL20Q9Y2M5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL20Q9Y2M5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL20Q9Y2M5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL20Q9Y2M5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL20Q9Y2M5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms