Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms