Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms