Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDRG4Q9ULP0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms