Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MKLN1Q9UL63 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MKLN1Q9UL63 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms