Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXO9Q9UK97 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms