Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIMS3Q9UJD0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms