Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APEX2Q9UBZ4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms