Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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