Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms