Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf78Q9NZ63 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms