Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms