Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDHAF2Q9NX18 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SDHAF2Q9NX18 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms