Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF275Q9NSD4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms