Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM7SF3Q9NS93 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms