Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms